定量蛋白組學(Quantitative Proteomics)是對細胞或組織中表達的全部蛋白質進行鑒定和定量。用于篩選和尋找任何因素引起的樣本間差異表達的蛋白,結合生物信息分析揭示生命體在不同生理或病理條件下的變化機制。目前已廣泛應用于醫學、農業、林業、水產、微生物等各生命科學領域,并將在相當長一段時間內持續推動著生命科學的發展。
高通量測序能通過測序儀對細胞或組織樣本中的DNA或RNA進行高效率、高通量的檢測分析,是生命科學領域進行科學研究的重要技術和手段。但生命體生理功能的真正執行者和生命現象的直接體現者是蛋白,只有對蛋白質結構和功能進行有效的研究才能真正直接和準確的闡明生命體在不同生理或病理條件下的變化機制。然而基于傳統雙向膠的蛋白組學由于能鑒定的蛋白種類少、實驗流程復雜、鑒定蛋白受分子量、疏水性、等電點等條件的限制,使得蛋白組學的發展和應用一直相對滯后。
近年來隨著高通量蛋白質譜的出現,使得蛋白種類的鑒定和轉錄組鑒定基因的種類達到了同一數量級,蛋白組學對于科學研究的意義越發凸顯。尤其2014年5月人類蛋白組草圖的公布,使得蛋白組學研究更加成為了廣大科研工作者關注的焦點。
TripleTOFTM 5600系統是第一個把廣泛定性探索,快速全貌解析,和高分辨率定量結合在一個單一精確質量平臺的系統。新一代的TripleTOF® 6600系統拓展了AB SCIEX TripleTOF®技術的特性和功能,再結合獨有的的SWATHTM2.0采集技術,具有卓越的性能和超凡重現性,一次定量數以千計的蛋白質。在最快采集速度條件下,用高分辨和準確質量質譜數據,完成無與倫比的蛋白質定性鑒定工作。
Thermo ScientificTM Orbitrap FusionTM 是賽默飛最高端的四極桿-靜電場軌道阱-線性離子阱三合一組合式質譜。Fusion 使用的Orbitrap為超高場Orbitrap質量分析器,相比于賽默飛其他Orbitrap系列產品,Fusion具有超高分辨、高靈敏度、多級質譜能力,并且配備多種裂解模式(CID、HCD及可升級的ETD),非常適合蛋白質組學中復雜體系的高通量蛋白檢測。
技術主流應用:iTRAQ、Lable-free等。
對多個分組中的蛋白樣本進行定量比較,尋找差異蛋白,并對差異蛋白進行功能注釋和聚類分析。
技術路線:
針對雙向膠(或單向膠)挖取的單個膠點蛋白進行質譜鑒定分析。
技術路線:
組織或細胞樣本中蛋白組分分析,目的在于識別盡可能多的多肽或蛋白,并進行功能分析。
技術路線:
對樣本中蛋白的翻譯后修飾類型和位點進行鑒定和功能分析,闡釋其在信號轉導途徑中的功能。
技術路線:
主要對蛋白的表達水平進行大樣本的驗證,包括WB、IHC、Elisa等。
技術路線:
對挑選的目標蛋白在細胞或動物水平進行過表達或敲低后,驗證其對細胞或動物表型、相關通路蛋白或重要因子表達的影響。
技術路線:
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